院系名称
专业名称
导师姓名
导师信息修改
熊杰

性  别:
出生日期: 1984.11
职  称: 副研究员
工作单位: 中国科学院水生生物研究所(联合培养基地)
行政职务: 无 
联系电话: 027-68780209 
电子信箱: xiongjie@ihb.ac.cn 
学术任职: 原生动物学分会理事及副秘书长 
荣誉称号: 中国科学院青年创新促进会优秀会员 
个人简介


熊杰,男,博士,副研究员,硕士生导师。2007年毕业于南京农业大学,获农学学士学位。2012年毕业于中国科学院水生生物研究所水生生物学专业,获理学博士学位。20148-20158月在美国密歇根大学从事博士后研究。长期以来,一直以原生动物纤毛虫,尤其是模式生物--四膜虫为研究对象,开展进化及基因组学研究。主持国家自然科学基金面上项目、青年科学基金项目及中国科学院青年创新促进会人才专项等项目8项。在PLOS biologyGenes & DevelopmentNucleic Acids ResearchDatabaseBMC Evolutionary BiologyScientific Reports等学术期刊上发表论文30余篇。2016年入选中国科学院青年创新促进会会员,2020年入选中国科学院水生生物研究所科研青年学者2020年入选中国科学院青年创新促进会优秀会员。

学习经历

起止年月

学校

所学专业

学历

学位

2005.09-2008.07

南京农业大学

动物科学与技术学

学士 本科
2008.09-2013.07 中国科学院水生生物研究所 水生生物学 研究生 博士





工作经历

起止年月

工作单位

任职

2012.03-2015.12

中国科学院水生生物研究所 助理研究员

2014.08-2015.08

美国密歇根大学
访问学者

2015.12-至今

中国科学院水生生物研究所 副研究员
承担科研课题情况

序号

项目名称

项目来源

起止年月

经费
(万元)

主持/参加

完成情况

1

原生动物进化基因组学

中国科学院青年创新促进会优秀会员人才专

2021/01-2024/12

200 主持 进行中
2

汞、镉感知转化元件的功能验证和标准化

国家重点研发计划合成生物学专项子课题

2020/11-2024/10

115 主持 进行中
3

原生动物四膜虫生殖小核(germline nucleus)体功能(somatic function)的分子基础研究

国家自然基金面上项目

2019/01-2022/12

60 主持 进行中
4

渔业水域生境生物多样性的宏基因组调查方法

国家重点研发计划蓝色粮仓科技创新重点专项子课题

2018/01-2022/12

62.3

主持 进行中
5

三种四膜虫全基因组N6-甲基腺嘌呤的鉴定及其功能进化

国家自然基金面上项目

2017/01-2020/12

64 主持
结题
科研获奖情况

序号

获奖项目名称

奖励类别(等级)

授予单位

获奖时间

本人排名

授权专利情况

序号

专利名称

授权专利号

年份

专利类别
(发明/实用新型)

本人排名

论文与专著情况

序号

论文、专著名称

学术期刊或出版社名称

发表(出版)年份

论文
检索情况

作(著)者
名次

1

Identification and characterization of base-substitution mutations in the macronuclear genome of the ciliate Tetrahymena thermophila

Genome Biology and Evolution

2021 SCI 共同通讯作者
2

A strategy for complete telomere-to-telomere assembly of ciliate macronuclear genome using ultra-high coverage Nanopore data

Computational and Structural Biotechnology Journal

2021 SCI 共同通讯作者
3

Proteomic identification and expression of oral apparatus constituents in cell regeneration of giant ciliate Stentor coeruleus (strain WHEL)

Gene
2020 SCI 通讯作者
4

Bacteria-derived hemolysis-related genes widely exist in scuticociliates

Microorganisms

2020 SCI 通讯作者
5

Hidden genomic evolution in a morphospecies-The landscape of rapidly evolving genes in Tetrahymena

PLOS Biology

2019 SCI 第一作者
6

Single-cell transcriptome sequencing of rumen ciliates provides insight into their molecular adaptations to the anaerobic and carbohydrate-rich rumen microenvironment

Molecular Phylogenetics and Evolution

2019 SCI 共同通讯作者
7

RNAi-dependent Polycomb repression controls transposable elements in Tetrahymena

Gene development


2019 SCI 共同第一作者
8

Tetrahymena Comparative Genomics Database (TCGD): a community resource for Tetrahymena

Database 2019 SCI 共同通讯作者
9

EOGD: The Euplotes octocarinatus genome database

BMC Genomics 2018
SCI 共同通讯作者
10

Pseudocohnilembus persalinus genome database - the first genome database of facultative scuticociliatosis pathogens

BMC Genomics

2018 SCI 共同通讯作者
11

Dissecting relative contributions of cis- and trans-determinants to nucleosome distribution by comparing Tetrahymena macronuclear and micronuclear chromatin

Nucleic Acids Research

2016 SCI 共同第一作者
12

Epidermal growth factor-induced stimulation of proliferation and gene expression changes in the hypotrichous ciliate, Stylonychia lemnae

Gene

2016 SCI 共同通讯作者
13

Genome of the facultative scuticociliatosis pathogen Pseudocohnilembus persalinus provides insight into its virulence through horizontal gene transfer

Scientific Reports

2015 SCI 第一作者
14

Distinct nucleosome distribution patterns in two structurally and functionally differentiated nuclei of a unicellular eukaryote

bioRxiv

2015
SCI
第一作者

指导研究生情况

在读人数

3

已毕业人数

1

所指导研究生在读期间取得的成绩和荣誉、就业去向等情况介绍

版权所有 (c) 大连海洋大学研究生学院 地址:辽宁省大连市沙河口区黑石礁街52号 邮编:116023